Į naujausią Lietuvos raudonosios knygos augalų rūšių sąrašą, patvirtintą 2003, įrašyti 358 rūšių augalai (iš jų 238 rūšių induočiai, 100 rūšių samanos, 20 rūšių dumbliai). Be to, 14 rūšių šalyje aptinkami augalai (12 rūšių induočiai ir 2 rūšių samanos) įrašyti į Europos Sąjungos buveinių direktyvos antrąjį priedą. Retųjų ir nykstančiųjų augalų apsauga yra neatsiejama visos aplinkos apsaugos dalis.